Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNX12Q9UMY4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX12Q9UMY4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms