Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULU4

ZMYND8, Protein kinase C-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMYND8Q9ULU4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZMYND8Q9ULU4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZMYND8Q9ULU4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZMYND8Q9ULU4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZMYND8Q9ULU4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZMYND8Q9ULU4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZMYND8Q9ULU4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZMYND8Q9ULU4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZMYND8Q9ULU4 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZMYND8Q9ULU4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZMYND8Q9ULU4 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZMYND8Q9ULU4 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZMYND8Q9ULU4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZMYND8Q9ULU4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZMYND8Q9ULU4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZMYND8Q9ULU4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZMYND8Q9ULU4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZMYND8Q9ULU4 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZMYND8Q9ULU4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZMYND8Q9ULU4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZMYND8Q9ULU4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZMYND8Q9ULU4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZMYND8Q9ULU4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZMYND8Q9ULU4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZMYND8Q9ULU4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZMYND8Q9ULU4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZMYND8Q9ULU4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZMYND8Q9ULU4 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZMYND8Q9ULU4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZMYND8Q9ULU4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZMYND8Q9ULU4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZMYND8Q9ULU4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZMYND8Q9ULU4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZMYND8Q9ULU4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZMYND8Q9ULU4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZMYND8Q9ULU4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZMYND8Q9ULU4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZMYND8Q9ULU4 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZMYND8Q9ULU4 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZMYND8Q9ULU4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZMYND8Q9ULU4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZMYND8Q9ULU4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZMYND8Q9ULU4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZMYND8Q9ULU4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZMYND8Q9ULU4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZMYND8Q9ULU4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZMYND8Q9ULU4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZMYND8Q9ULU4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZMYND8Q9ULU4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZMYND8Q9ULU4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZMYND8Q9ULU4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZMYND8Q9ULU4 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZMYND8Q9ULU4 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZMYND8Q9ULU4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ZMYND8Q9ULU4 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZMYND8Q9ULU4 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZMYND8Q9ULU4 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZMYND8Q9ULU4 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZMYND8Q9ULU4 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZMYND8Q9ULU4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZMYND8Q9ULU4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZMYND8Q9ULU4 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZMYND8Q9ULU4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZMYND8Q9ULU4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZMYND8Q9ULU4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZMYND8Q9ULU4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZMYND8Q9ULU4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZMYND8Q9ULU4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZMYND8Q9ULU4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZMYND8Q9ULU4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms