Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW2

PLXNA1, Plexin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 1,896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA1Q9UIW2 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLXNA1Q9UIW2 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
PLXNA1Q9UIW2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLXNA1Q9UIW2 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLXNA1Q9UIW2 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLXNA1Q9UIW2 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLXNA1Q9UIW2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLXNA1Q9UIW2 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLXNA1Q9UIW2 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLXNA1Q9UIW2 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLXNA1Q9UIW2 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLXNA1Q9UIW2 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PLXNA1Q9UIW2 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLXNA1Q9UIW2 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLXNA1Q9UIW2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLXNA1Q9UIW2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLXNA1Q9UIW2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLXNA1Q9UIW2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLXNA1Q9UIW2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLXNA1Q9UIW2 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLXNA1Q9UIW2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLXNA1Q9UIW2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLXNA1Q9UIW2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PLXNA1Q9UIW2 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PLXNA1Q9UIW2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PLXNA1Q9UIW2 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PLXNA1Q9UIW2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms