Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SRP68Q9UHB9 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SRP68Q9UHB9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRP68Q9UHB9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRP68Q9UHB9 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRP68Q9UHB9 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRP68Q9UHB9 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRP68Q9UHB9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRP68Q9UHB9 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRP68Q9UHB9 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRP68Q9UHB9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRP68Q9UHB9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRP68Q9UHB9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRP68Q9UHB9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRP68Q9UHB9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SRP68Q9UHB9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRP68Q9UHB9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRP68Q9UHB9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRP68Q9UHB9 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRP68Q9UHB9 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SRP68Q9UHB9 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRP68Q9UHB9 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRP68Q9UHB9 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRP68Q9UHB9 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRP68Q9UHB9 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRP68Q9UHB9 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRP68Q9UHB9 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRP68Q9UHB9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRP68Q9UHB9 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRP68Q9UHB9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRP68Q9UHB9 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRP68Q9UHB9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRP68Q9UHB9 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRP68Q9UHB9 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRP68Q9UHB9 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SRP68Q9UHB9 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SRP68Q9UHB9 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRP68Q9UHB9 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRP68Q9UHB9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRP68Q9UHB9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRP68Q9UHB9 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SRP68Q9UHB9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SRP68Q9UHB9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SRP68Q9UHB9 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SRP68Q9UHB9 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SRP68Q9UHB9 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SRP68Q9UHB9 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SRP68Q9UHB9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SRP68Q9UHB9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SRP68Q9UHB9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SRP68Q9UHB9 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SRP68Q9UHB9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SRP68Q9UHB9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SRP68Q9UHB9 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SRP68Q9UHB9 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SRP68Q9UHB9 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SRP68Q9UHB9 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SRP68Q9UHB9 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SRP68Q9UHB9 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SRP68Q9UHB9 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SRP68Q9UHB9 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SRP68Q9UHB9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRP68Q9UHB9 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRP68Q9UHB9 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRP68Q9UHB9 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRP68Q9UHB9 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRP68Q9UHB9 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRP68Q9UHB9 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SRP68Q9UHB9 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRP68Q9UHB9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRP68Q9UHB9 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SRP68Q9UHB9 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SRP68Q9UHB9 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SRP68Q9UHB9 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SRP68Q9UHB9 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SRP68Q9UHB9 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SRP68Q9UHB9 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SRP68Q9UHB9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SRP68Q9UHB9 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SRP68Q9UHB9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SRP68Q9UHB9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SRP68Q9UHB9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SRP68Q9UHB9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SRP68Q9UHB9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SRP68Q9UHB9 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SRP68Q9UHB9 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SRP68Q9UHB9 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SRP68Q9UHB9 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SRP68Q9UHB9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SRP68Q9UHB9 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SRP68Q9UHB9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SRP68Q9UHB9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SRP68Q9UHB9 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SRP68Q9UHB9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SRP68Q9UHB9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SRP68Q9UHB9 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SRP68Q9UHB9 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SRP68Q9UHB9 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SRP68Q9UHB9 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SRP68Q9UHB9 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms