Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CLN8Q9UBY8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN8Q9UBY8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN8Q9UBY8 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN8Q9UBY8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN8Q9UBY8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN8Q9UBY8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN8Q9UBY8 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN8Q9UBY8 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN8Q9UBY8 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN8Q9UBY8 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN8Q9UBY8 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN8Q9UBY8 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN8Q9UBY8 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN8Q9UBY8 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN8Q9UBY8 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN8Q9UBY8 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN8Q9UBY8 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN8Q9UBY8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN8Q9UBY8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN8Q9UBY8 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN8Q9UBY8 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN8Q9UBY8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN8Q9UBY8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN8Q9UBY8 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN8Q9UBY8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN8Q9UBY8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN8Q9UBY8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN8Q9UBY8 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN8Q9UBY8 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN8Q9UBY8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN8Q9UBY8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN8Q9UBY8 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN8Q9UBY8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN8Q9UBY8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN8Q9UBY8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN8Q9UBY8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN8Q9UBY8 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN8Q9UBY8 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN8Q9UBY8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN8Q9UBY8 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN8Q9UBY8 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN8Q9UBY8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN8Q9UBY8 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN8Q9UBY8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN8Q9UBY8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN8Q9UBY8 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN8Q9UBY8 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN8Q9UBY8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN8Q9UBY8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN8Q9UBY8 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN8Q9UBY8 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN8Q9UBY8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms