Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC7

GALP, Galanin-like peptide, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALPQ9UBC7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GALPQ9UBC7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms