Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGAP28Q9P2N2 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms