Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
DLL3Q9NYJ7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
DLL3Q9NYJ7 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms