Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXC10Q9NYD6 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.7 ms