Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VNN3Q9NY84 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms