Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY35

CLDND1, Claudin domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 253 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDND1Q9NY35 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLDND1Q9NY35 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDND1Q9NY35 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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