Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR0

KLHL11, Kelch-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL11Q9NVR0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL11Q9NVR0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KLHL11Q9NVR0 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
KLHL11Q9NVR0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
KLHL11Q9NVR0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KLHL11Q9NVR0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KLHL11Q9NVR0 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
KLHL11Q9NVR0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL11Q9NVR0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL11Q9NVR0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL11Q9NVR0 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL11Q9NVR0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL11Q9NVR0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL11Q9NVR0 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL11Q9NVR0 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL11Q9NVR0 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL11Q9NVR0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL11Q9NVR0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.32■■□□□ 1
KLHL11Q9NVR0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL11Q9NVR0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL11Q9NVR0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL11Q9NVR0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL11Q9NVR0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL11Q9NVR0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL11Q9NVR0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL11Q9NVR0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL11Q9NVR0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL11Q9NVR0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL11Q9NVR0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL11Q9NVR0 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL11Q9NVR0 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL11Q9NVR0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL11Q9NVR0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL11Q9NVR0 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL11Q9NVR0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL11Q9NVR0 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL11Q9NVR0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL11Q9NVR0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL11Q9NVR0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL11Q9NVR0 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL11Q9NVR0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms