Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI1

FANCI, Fanconi anemia group I protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCIQ9NVI1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FANCIQ9NVI1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FANCIQ9NVI1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
FANCIQ9NVI1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
FANCIQ9NVI1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FANCIQ9NVI1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FANCIQ9NVI1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FANCIQ9NVI1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FANCIQ9NVI1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FANCIQ9NVI1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FANCIQ9NVI1 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FANCIQ9NVI1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FANCIQ9NVI1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FANCIQ9NVI1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FANCIQ9NVI1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FANCIQ9NVI1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FANCIQ9NVI1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FANCIQ9NVI1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FANCIQ9NVI1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FANCIQ9NVI1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FANCIQ9NVI1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FANCIQ9NVI1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FANCIQ9NVI1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FANCIQ9NVI1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FANCIQ9NVI1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FANCIQ9NVI1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
FANCIQ9NVI1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FANCIQ9NVI1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
FANCIQ9NVI1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FANCIQ9NVI1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FANCIQ9NVI1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FANCIQ9NVI1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FANCIQ9NVI1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FANCIQ9NVI1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FANCIQ9NVI1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FANCIQ9NVI1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FANCIQ9NVI1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FANCIQ9NVI1 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FANCIQ9NVI1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
FANCIQ9NVI1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FANCIQ9NVI1 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FANCIQ9NVI1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FANCIQ9NVI1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FANCIQ9NVI1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FANCIQ9NVI1 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FANCIQ9NVI1 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FANCIQ9NVI1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FANCIQ9NVI1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FANCIQ9NVI1 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FANCIQ9NVI1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FANCIQ9NVI1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FANCIQ9NVI1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FANCIQ9NVI1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FANCIQ9NVI1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FANCIQ9NVI1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FANCIQ9NVI1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FANCIQ9NVI1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
FANCIQ9NVI1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FANCIQ9NVI1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FANCIQ9NVI1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
FANCIQ9NVI1 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FANCIQ9NVI1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FANCIQ9NVI1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FANCIQ9NVI1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FANCIQ9NVI1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FANCIQ9NVI1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FANCIQ9NVI1 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FANCIQ9NVI1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FANCIQ9NVI1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
FANCIQ9NVI1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
FANCIQ9NVI1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FANCIQ9NVI1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FANCIQ9NVI1 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FANCIQ9NVI1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FANCIQ9NVI1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FANCIQ9NVI1 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FANCIQ9NVI1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
FANCIQ9NVI1 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FANCIQ9NVI1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FANCIQ9NVI1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FANCIQ9NVI1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FANCIQ9NVI1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FANCIQ9NVI1 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FANCIQ9NVI1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FANCIQ9NVI1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FANCIQ9NVI1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
FANCIQ9NVI1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FANCIQ9NVI1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FANCIQ9NVI1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
FANCIQ9NVI1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FANCIQ9NVI1 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FANCIQ9NVI1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FANCIQ9NVI1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FANCIQ9NVI1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FANCIQ9NVI1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FANCIQ9NVI1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FANCIQ9NVI1 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FANCIQ9NVI1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FANCIQ9NVI1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FANCIQ9NVI1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms