Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV12

TMEM140, Transmembrane protein 140, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM140Q9NV12 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM140Q9NV12 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms