Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GINM1Q9NU53 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GINM1Q9NU53 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms