Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT82Q9NSB4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms