Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS56

TOPORS, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPORSQ9NS56 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TOPORSQ9NS56 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOPORSQ9NS56 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms