Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB6BQ9NRW1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB6BQ9NRW1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB6BQ9NRW1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB6BQ9NRW1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB6BQ9NRW1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB6BQ9NRW1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB6BQ9NRW1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB6BQ9NRW1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB6BQ9NRW1 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB6BQ9NRW1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB6BQ9NRW1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB6BQ9NRW1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB6BQ9NRW1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB6BQ9NRW1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB6BQ9NRW1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB6BQ9NRW1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB6BQ9NRW1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB6BQ9NRW1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB6BQ9NRW1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB6BQ9NRW1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB6BQ9NRW1 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB6BQ9NRW1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms