Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DUOX1Q9NRD9 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
DUOX1Q9NRD9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DUOX1Q9NRD9 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DUOX1Q9NRD9 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DUOX1Q9NRD9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DUOX1Q9NRD9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DUOX1Q9NRD9 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DUOX1Q9NRD9 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DUOX1Q9NRD9 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DUOX1Q9NRD9 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DUOX1Q9NRD9 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DUOX1Q9NRD9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DUOX1Q9NRD9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DUOX1Q9NRD9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DUOX1Q9NRD9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DUOX1Q9NRD9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DUOX1Q9NRD9 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DUOX1Q9NRD9 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DUOX1Q9NRD9 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DUOX1Q9NRD9 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DUOX1Q9NRD9 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DUOX1Q9NRD9 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DUOX1Q9NRD9 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
DUOX1Q9NRD9 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DUOX1Q9NRD9 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DUOX1Q9NRD9 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DUOX1Q9NRD9 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DUOX1Q9NRD9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DUOX1Q9NRD9 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DUOX1Q9NRD9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DUOX1Q9NRD9 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DUOX1Q9NRD9 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DUOX1Q9NRD9 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DUOX1Q9NRD9 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DUOX1Q9NRD9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DUOX1Q9NRD9 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DUOX1Q9NRD9 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DUOX1Q9NRD9 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
DUOX1Q9NRD9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DUOX1Q9NRD9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DUOX1Q9NRD9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DUOX1Q9NRD9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DUOX1Q9NRD9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DUOX1Q9NRD9 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DUOX1Q9NRD9 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DUOX1Q9NRD9 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DUOX1Q9NRD9 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
DUOX1Q9NRD9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
DUOX1Q9NRD9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
DUOX1Q9NRD9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
DUOX1Q9NRD9 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DUOX1Q9NRD9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms