Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR23

GDF3, Growth/differentiation factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF3Q9NR23 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDF3Q9NR23 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDF3Q9NR23 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDF3Q9NR23 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDF3Q9NR23 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDF3Q9NR23 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GDF3Q9NR23 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDF3Q9NR23 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDF3Q9NR23 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDF3Q9NR23 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDF3Q9NR23 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDF3Q9NR23 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDF3Q9NR23 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDF3Q9NR23 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDF3Q9NR23 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDF3Q9NR23 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDF3Q9NR23 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDF3Q9NR23 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDF3Q9NR23 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDF3Q9NR23 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GDF3Q9NR23 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms