Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQY0

BIN3, Bridging integrator 3, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN3Q9NQY0 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BIN3Q9NQY0 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms