Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG5

RPRD1B, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1BQ9NQG5 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPRD1BQ9NQG5 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms