Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYLDQ9NQC7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYLDQ9NQC7 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
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