Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HMG20AQ9NP66 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms