Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BCAS3Q9H6U6 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCAS3Q9H6U6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms