Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6D8

FNDC4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC4Q9H6D8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC4Q9H6D8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms