Protein–RNA interactions for Protein: Q9H422

HIPK3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIPK3Q9H422 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
HIPK3Q9H422 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIPK3Q9H422 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms