Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ7

GFRA4, GDNF family receptor alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA4Q9GZZ7 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms