Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYX4

IFIH1, Interferon-induced helicase C domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIH1Q9BYX4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFIH1Q9BYX4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms