Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GABARAPL3Q9BY60 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GABARAPL3Q9BY60 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms