Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SCAPERQ9BY12 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SCAPERQ9BY12 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SCAPERQ9BY12 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SCAPERQ9BY12 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SCAPERQ9BY12 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SCAPERQ9BY12 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SCAPERQ9BY12 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SCAPERQ9BY12 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SCAPERQ9BY12 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SCAPERQ9BY12 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SCAPERQ9BY12 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SCAPERQ9BY12 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
SCAPERQ9BY12 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SCAPERQ9BY12 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
SCAPERQ9BY12 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SCAPERQ9BY12 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
SCAPERQ9BY12 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
SCAPERQ9BY12 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
SCAPERQ9BY12 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
SCAPERQ9BY12 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.53
SCAPERQ9BY12 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SCAPERQ9BY12 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SCAPERQ9BY12 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
SCAPERQ9BY12 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
SCAPERQ9BY12 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SCAPERQ9BY12 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SCAPERQ9BY12 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
SCAPERQ9BY12 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SCAPERQ9BY12 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SCAPERQ9BY12 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SCAPERQ9BY12 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SCAPERQ9BY12 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
SCAPERQ9BY12 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SCAPERQ9BY12 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SCAPERQ9BY12 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SCAPERQ9BY12 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SCAPERQ9BY12 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SCAPERQ9BY12 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SCAPERQ9BY12 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SCAPERQ9BY12 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SCAPERQ9BY12 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SCAPERQ9BY12 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SCAPERQ9BY12 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
SCAPERQ9BY12 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SCAPERQ9BY12 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SCAPERQ9BY12 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SCAPERQ9BY12 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SCAPERQ9BY12 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SCAPERQ9BY12 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SCAPERQ9BY12 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SCAPERQ9BY12 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SCAPERQ9BY12 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SCAPERQ9BY12 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SCAPERQ9BY12 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SCAPERQ9BY12 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SCAPERQ9BY12 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SCAPERQ9BY12 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SCAPERQ9BY12 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SCAPERQ9BY12 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
SCAPERQ9BY12 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SCAPERQ9BY12 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SCAPERQ9BY12 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SCAPERQ9BY12 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SCAPERQ9BY12 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SCAPERQ9BY12 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SCAPERQ9BY12 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SCAPERQ9BY12 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SCAPERQ9BY12 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SCAPERQ9BY12 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SCAPERQ9BY12 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SCAPERQ9BY12 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SCAPERQ9BY12 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SCAPERQ9BY12 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SCAPERQ9BY12 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SCAPERQ9BY12 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SCAPERQ9BY12 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SCAPERQ9BY12 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SCAPERQ9BY12 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SCAPERQ9BY12 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SCAPERQ9BY12 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SCAPERQ9BY12 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
SCAPERQ9BY12 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SCAPERQ9BY12 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SCAPERQ9BY12 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SCAPERQ9BY12 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SCAPERQ9BY12 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SCAPERQ9BY12 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SCAPERQ9BY12 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SCAPERQ9BY12 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SCAPERQ9BY12 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SCAPERQ9BY12 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SCAPERQ9BY12 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
SCAPERQ9BY12 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SCAPERQ9BY12 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SCAPERQ9BY12 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SCAPERQ9BY12 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SCAPERQ9BY12 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
SCAPERQ9BY12 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
SCAPERQ9BY12 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms