Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRRTQ9BXP5 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms