Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
VN1R3Q9BXE9 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VN1R3Q9BXE9 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms