Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
RBM42Q9BTD8 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RBM42Q9BTD8 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms