Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GINS3Q9BRX5 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GINS3Q9BRX5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms