Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRQ6

CHCHD6, MICOS complex subunit MIC25, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD6Q9BRQ6 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHCHD6Q9BRQ6 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms