Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TREX2Q9BQ50 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TREX2Q9BQ50 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms