Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PHOX2BQ99453 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PHOX2BQ99453 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PHOX2BQ99453 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PHOX2BQ99453 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PHOX2BQ99453 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms