Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CRBNQ96SW2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CRBNQ96SW2 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CRBNQ96SW2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CRBNQ96SW2 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CRBNQ96SW2 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CRBNQ96SW2 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CRBNQ96SW2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CRBNQ96SW2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CRBNQ96SW2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CRBNQ96SW2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CRBNQ96SW2 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CRBNQ96SW2 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CRBNQ96SW2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CRBNQ96SW2 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CRBNQ96SW2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CRBNQ96SW2 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CRBNQ96SW2 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CRBNQ96SW2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CRBNQ96SW2 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CRBNQ96SW2 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CRBNQ96SW2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CRBNQ96SW2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CRBNQ96SW2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CRBNQ96SW2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CRBNQ96SW2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CRBNQ96SW2 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CRBNQ96SW2 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CRBNQ96SW2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CRBNQ96SW2 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CRBNQ96SW2 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CRBNQ96SW2 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CRBNQ96SW2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CRBNQ96SW2 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CRBNQ96SW2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms