Protein–RNA interactions for Protein: Q96PL1

SCGB3A2, Secretoglobin family 3A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB3A2Q96PL1 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCGB3A2Q96PL1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCGB3A2Q96PL1 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCGB3A2Q96PL1 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCGB3A2Q96PL1 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCGB3A2Q96PL1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCGB3A2Q96PL1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCGB3A2Q96PL1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCGB3A2Q96PL1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCGB3A2Q96PL1 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCGB3A2Q96PL1 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCGB3A2Q96PL1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCGB3A2Q96PL1 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCGB3A2Q96PL1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCGB3A2Q96PL1 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCGB3A2Q96PL1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCGB3A2Q96PL1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCGB3A2Q96PL1 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCGB3A2Q96PL1 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCGB3A2Q96PL1 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCGB3A2Q96PL1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCGB3A2Q96PL1 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCGB3A2Q96PL1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCGB3A2Q96PL1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCGB3A2Q96PL1 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCGB3A2Q96PL1 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCGB3A2Q96PL1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCGB3A2Q96PL1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCGB3A2Q96PL1 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCGB3A2Q96PL1 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCGB3A2Q96PL1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCGB3A2Q96PL1 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCGB3A2Q96PL1 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCGB3A2Q96PL1 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCGB3A2Q96PL1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCGB3A2Q96PL1 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SCGB3A2Q96PL1 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCGB3A2Q96PL1 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCGB3A2Q96PL1 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCGB3A2Q96PL1 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCGB3A2Q96PL1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCGB3A2Q96PL1 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCGB3A2Q96PL1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCGB3A2Q96PL1 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCGB3A2Q96PL1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCGB3A2Q96PL1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCGB3A2Q96PL1 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCGB3A2Q96PL1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCGB3A2Q96PL1 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCGB3A2Q96PL1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCGB3A2Q96PL1 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCGB3A2Q96PL1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCGB3A2Q96PL1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCGB3A2Q96PL1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCGB3A2Q96PL1 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCGB3A2Q96PL1 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCGB3A2Q96PL1 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCGB3A2Q96PL1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SCGB3A2Q96PL1 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SCGB3A2Q96PL1 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SCGB3A2Q96PL1 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SCGB3A2Q96PL1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SCGB3A2Q96PL1 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SCGB3A2Q96PL1 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SCGB3A2Q96PL1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SCGB3A2Q96PL1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SCGB3A2Q96PL1 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SCGB3A2Q96PL1 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SCGB3A2Q96PL1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SCGB3A2Q96PL1 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCGB3A2Q96PL1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCGB3A2Q96PL1 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCGB3A2Q96PL1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCGB3A2Q96PL1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCGB3A2Q96PL1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCGB3A2Q96PL1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCGB3A2Q96PL1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCGB3A2Q96PL1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCGB3A2Q96PL1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SCGB3A2Q96PL1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCGB3A2Q96PL1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCGB3A2Q96PL1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SCGB3A2Q96PL1 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCGB3A2Q96PL1 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCGB3A2Q96PL1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCGB3A2Q96PL1 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCGB3A2Q96PL1 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCGB3A2Q96PL1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCGB3A2Q96PL1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCGB3A2Q96PL1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCGB3A2Q96PL1 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCGB3A2Q96PL1 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCGB3A2Q96PL1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCGB3A2Q96PL1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCGB3A2Q96PL1 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCGB3A2Q96PL1 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCGB3A2Q96PL1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SCGB3A2Q96PL1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCGB3A2Q96PL1 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SCGB3A2Q96PL1 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms