Protein–RNA interactions for Protein: Q96IS3

RAX2, Retina and anterior neural fold homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAX2Q96IS3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms