Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms