Protein–RNA interactions for Protein: Q96FC9

DDX11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, humanhuman

Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX11Q96FC9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX11Q96FC9 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms