Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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TRIM63Q969Q1 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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TRIM63Q969Q1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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TRIM63Q969Q1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM63Q969Q1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM63Q969Q1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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