Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
TRIM41Q8WV44 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
TRIM41Q8WV44 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
TRIM41Q8WV44 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
TRIM41Q8WV44 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
TRIM41Q8WV44 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC35■■■■□ 3.19
TRIM41Q8WV44 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
TRIM41Q8WV44 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
TRIM41Q8WV44 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
TRIM41Q8WV44 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
TRIM41Q8WV44 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
TRIM41Q8WV44 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
TRIM41Q8WV44 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
TRIM41Q8WV44 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC34.99■■■■□ 3.19
TRIM41Q8WV44 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
TRIM41Q8WV44 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
TRIM41Q8WV44 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
TRIM41Q8WV44 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
TRIM41Q8WV44 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
TRIM41Q8WV44 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
TRIM41Q8WV44 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
TRIM41Q8WV44 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
TRIM41Q8WV44 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
TRIM41Q8WV44 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
TRIM41Q8WV44 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
TRIM41Q8WV44 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
TRIM41Q8WV44 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
TRIM41Q8WV44 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
TRIM41Q8WV44 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
TRIM41Q8WV44 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
TRIM41Q8WV44 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
TRIM41Q8WV44 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
TRIM41Q8WV44 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
TRIM41Q8WV44 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
TRIM41Q8WV44 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
TRIM41Q8WV44 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
TRIM41Q8WV44 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
TRIM41Q8WV44 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
TRIM41Q8WV44 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC34.97■■■■□ 3.19
TRIM41Q8WV44 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
TRIM41Q8WV44 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
TRIM41Q8WV44 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
TRIM41Q8WV44 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
TRIM41Q8WV44 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
TRIM41Q8WV44 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
TRIM41Q8WV44 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
TRIM41Q8WV44 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
TRIM41Q8WV44 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
TRIM41Q8WV44 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
TRIM41Q8WV44 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
TRIM41Q8WV44 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
TRIM41Q8WV44 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
TRIM41Q8WV44 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
TRIM41Q8WV44 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
TRIM41Q8WV44 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
TRIM41Q8WV44 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
TRIM41Q8WV44 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
TRIM41Q8WV44 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
TRIM41Q8WV44 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
TRIM41Q8WV44 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
TRIM41Q8WV44 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
TRIM41Q8WV44 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
TRIM41Q8WV44 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
TRIM41Q8WV44 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
TRIM41Q8WV44 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
TRIM41Q8WV44 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
TRIM41Q8WV44 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
TRIM41Q8WV44 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC34.95■■■■□ 3.19
TRIM41Q8WV44 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
TRIM41Q8WV44 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.18
TRIM41Q8WV44 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.18
TRIM41Q8WV44 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
TRIM41Q8WV44 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
TRIM41Q8WV44 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
TRIM41Q8WV44 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
TRIM41Q8WV44 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
TRIM41Q8WV44 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
TRIM41Q8WV44 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
TRIM41Q8WV44 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
TRIM41Q8WV44 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
TRIM41Q8WV44 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
TRIM41Q8WV44 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
TRIM41Q8WV44 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
TRIM41Q8WV44 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
TRIM41Q8WV44 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
TRIM41Q8WV44 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
TRIM41Q8WV44 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
TRIM41Q8WV44 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
TRIM41Q8WV44 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
TRIM41Q8WV44 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
TRIM41Q8WV44 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
TRIM41Q8WV44 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC34.93■■■■□ 3.18
TRIM41Q8WV44 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
TRIM41Q8WV44 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
TRIM41Q8WV44 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
TRIM41Q8WV44 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC34.93■■■■□ 3.18
TRIM41Q8WV44 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
TRIM41Q8WV44 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
TRIM41Q8WV44 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC34.92■■■■□ 3.18
TRIM41Q8WV44 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms