Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTU0

DDI1, Protein DDI1 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDI1Q8WTU0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DDI1Q8WTU0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
DDI1Q8WTU0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
DDI1Q8WTU0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
DDI1Q8WTU0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
DDI1Q8WTU0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDI1Q8WTU0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDI1Q8WTU0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDI1Q8WTU0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDI1Q8WTU0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDI1Q8WTU0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDI1Q8WTU0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDI1Q8WTU0 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDI1Q8WTU0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDI1Q8WTU0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDI1Q8WTU0 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDI1Q8WTU0 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDI1Q8WTU0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDI1Q8WTU0 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDI1Q8WTU0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDI1Q8WTU0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDI1Q8WTU0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DDI1Q8WTU0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DDI1Q8WTU0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DDI1Q8WTU0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DDI1Q8WTU0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DDI1Q8WTU0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DDI1Q8WTU0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
DDI1Q8WTU0 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DDI1Q8WTU0 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DDI1Q8WTU0 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DDI1Q8WTU0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DDI1Q8WTU0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DDI1Q8WTU0 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DDI1Q8WTU0 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DDI1Q8WTU0 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DDI1Q8WTU0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DDI1Q8WTU0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DDI1Q8WTU0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DDI1Q8WTU0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DDI1Q8WTU0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DDI1Q8WTU0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DDI1Q8WTU0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DDI1Q8WTU0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DDI1Q8WTU0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DDI1Q8WTU0 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DDI1Q8WTU0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DDI1Q8WTU0 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DDI1Q8WTU0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DDI1Q8WTU0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DDI1Q8WTU0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DDI1Q8WTU0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DDI1Q8WTU0 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DDI1Q8WTU0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DDI1Q8WTU0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DDI1Q8WTU0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DDI1Q8WTU0 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DDI1Q8WTU0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DDI1Q8WTU0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DDI1Q8WTU0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DDI1Q8WTU0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DDI1Q8WTU0 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DDI1Q8WTU0 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DDI1Q8WTU0 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DDI1Q8WTU0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DDI1Q8WTU0 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DDI1Q8WTU0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DDI1Q8WTU0 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DDI1Q8WTU0 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DDI1Q8WTU0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DDI1Q8WTU0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DDI1Q8WTU0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DDI1Q8WTU0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DDI1Q8WTU0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DDI1Q8WTU0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DDI1Q8WTU0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DDI1Q8WTU0 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DDI1Q8WTU0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DDI1Q8WTU0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DDI1Q8WTU0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms