Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX29Q8TEQ0 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms