Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC197Q8NCU1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC197Q8NCU1 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC197Q8NCU1 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC197Q8NCU1 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC197Q8NCU1 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC197Q8NCU1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC197Q8NCU1 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC197Q8NCU1 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC197Q8NCU1 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms