Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBJ5

COLGALT1, Procollagen galactosyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLGALT1Q8NBJ5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
COLGALT1Q8NBJ5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COLGALT1Q8NBJ5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COLGALT1Q8NBJ5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COLGALT1Q8NBJ5 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COLGALT1Q8NBJ5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COLGALT1Q8NBJ5 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COLGALT1Q8NBJ5 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
COLGALT1Q8NBJ5 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COLGALT1Q8NBJ5 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COLGALT1Q8NBJ5 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COLGALT1Q8NBJ5 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
COLGALT1Q8NBJ5 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COLGALT1Q8NBJ5 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms