Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
DTX3Q8N9I9 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms